पाइरीमिडीन एक सुगंधित विषमचक्रीय यौगिक है, इसमें पहले और तीसरे स्थान पर नाइट्रोजन परमाणु होते हैं। पाइरीमिडीन डेरिवेटिव में न्यूक्लियोटाइड थायमिन और एलोक्सन शामिल हैं। यूरिक एसिड और एलोक्सन जैसे पाइरीमिडीन डेरिवेटिव 19वीं सदी की शुरुआत में ज्ञात थे। पाइरीमिडीन से प्राप्त या संरचनात्मक रूप से संबंधित कई कार्बनिक यौगिकों में से कोई भी नाइट्रोजन आधार यूरैसिल साइटोसिन और थाइमिन है।
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